Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms