Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22BO75396 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22BO75396 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22BO75396 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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SEC22BO75396 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SEC22BO75396 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEC22BO75396 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SEC22BO75396 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEC22BO75396 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEC22BO75396 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEC22BO75396 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SEC22BO75396 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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SEC22BO75396 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SEC22BO75396 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEC22BO75396 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEC22BO75396 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SEC22BO75396 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEC22BO75396 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEC22BO75396 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEC22BO75396 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEC22BO75396 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEC22BO75396 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEC22BO75396 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEC22BO75396 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEC22BO75396 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SEC22BO75396 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEC22BO75396 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEC22BO75396 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEC22BO75396 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SEC22BO75396 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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