Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms