Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms