Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms