Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MLH3Q9UHC1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms