Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms