Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms