Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms