Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms