Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PCSK7Q16549 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PCSK7Q16549 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PCSK7Q16549 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PCSK7Q16549 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PCSK7Q16549 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PCSK7Q16549 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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