Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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