Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 GACAT2-201ENST00000579368 818 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
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