Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms