Protein–RNA interactions for Protein: Q13371

PDCL, Phosducin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCLQ13371 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms