Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RLFQ13129 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLFQ13129 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLFQ13129 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLFQ13129 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLFQ13129 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLFQ13129 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLFQ13129 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLFQ13129 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLFQ13129 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLFQ13129 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLFQ13129 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RLFQ13129 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RLFQ13129 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLFQ13129 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLFQ13129 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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