Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP1B1Q10567 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.2 ms