Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 PLGLB2-201ENST00000359481 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 CFAP61-203ENST00000377293 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC091946.1-201ENST00000522350 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 LINC01146-206ENST00000556684 361 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 LINC02184-201ENST00000568121 552 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AL450332.1-203ENST00000638742 1268 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 TRIM64EP-201ENST00000531233 1307 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 S100Z-201ENST00000317593 1468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 PPP1R2P10-201ENST00000393023 595 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AL450309.1-201ENST00000423792 656 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 PPP1R2P1-210ENST00000429032 618 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AL133325.2-201ENST00000431034 449 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 UBTFL5-201ENST00000443682 1191 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 CNOT8-217ENST00000521450 1158 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC027290.1-201ENST00000537827 484 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 PILRA-201ENST00000198536 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms