Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms