Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms