Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
LOXL3P58215 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms