Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms