Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms