Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMPOP42166 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMPOP42166 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMPOP42166 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMPOP42166 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMPOP42166 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMPOP42166 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMPOP42166 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMPOP42166 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMPOP42166 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMPOP42166 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TMPOP42166 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMPOP42166 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMPOP42166 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TMPOP42166 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMPOP42166 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TMPOP42166 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMPOP42166 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TMPOP42166 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMPOP42166 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMPOP42166 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMPOP42166 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMPOP42166 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMPOP42166 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMPOP42166 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMPOP42166 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMPOP42166 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TMPOP42166 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TMPOP42166 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TMPOP42166 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMPOP42166 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMPOP42166 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMPOP42166 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMPOP42166 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMPOP42166 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMPOP42166 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMPOP42166 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TMPOP42166 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMPOP42166 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMPOP42166 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMPOP42166 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMPOP42166 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMPOP42166 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMPOP42166 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMPOP42166 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMPOP42166 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMPOP42166 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMPOP42166 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMPOP42166 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TMPOP42166 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMPOP42166 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMPOP42166 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TMPOP42166 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMPOP42166 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMPOP42166 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMPOP42166 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMPOP42166 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMPOP42166 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMPOP42166 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMPOP42166 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms