Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRGAP2CP0DJJ0 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms