Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
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PKHD1P08F94 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
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