Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 TCF4-208ENST00000543082 2399 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 FOXN3P1-201ENST00000325117 1480 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 DCAKD-202ENST00000342350 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 DCAKD-203ENST00000452796 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 AC139100.1-201ENST00000588950 2035 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 H3F3A-202ENST00000366814 1863 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 AL133467.2-201ENST00000555032 1714 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 BCL2L13-211ENST00000493680 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 C17orf80-205ENST00000535032 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 CALCOCO2-203ENST00000416445 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 ASB8-205ENST00000536549 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 SIRPG-201ENST00000216927 831 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 MBD3L1-201ENST00000305625 748 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 CIART-202ENST00000369094 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 RPLP0-203ENST00000392514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF267-202ENST00000394846 680 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 HP-204ENST00000398131 1252 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01799-201ENST00000411701 386 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 SNX18P3-201ENST00000424993 835 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 KRBOX1-203ENST00000426937 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 AL512328.1-203ENST00000428480 673 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 OR7E33P-201ENST00000437705 966 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 AL353596.1-201ENST00000447508 790 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 NPIPB3-202ENST00000448012 1216 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 HSPA8P20-201ENST00000448737 1007 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 AC003035.2-201ENST00000448948 696 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 HNRNPA1P26-201ENST00000457695 1092 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 AC008667.3-201ENST00000506892 553 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 AC017007.1-201ENST00000511960 415 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 HAVCR2-204ENST00000522593 975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 NANOGP1-201ENST00000525030 915 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01499-203ENST00000530379 555 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 AC084361.1-201ENST00000537730 607 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP9-9Q9BYP9 CYP19A1-210ENST00000557858 832 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.3 ms