Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms