Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 RTN1-203ENST00000395090 1609 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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