Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 DERL2-206ENST00000572834 589 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AC015912.3-201ENST00000619432 348 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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