Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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COL4A6Q14031 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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COL4A6Q14031 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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COL4A6Q14031 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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COL4A6Q14031 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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COL4A6Q14031 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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COL4A6Q14031 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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COL4A6Q14031 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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