Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms