Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms