Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBP5P82980 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBP5P82980 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBP5P82980 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RBP5P82980 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBP5P82980 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP5P82980 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP5P82980 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP5P82980 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP5P82980 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP5P82980 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP5P82980 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP5P82980 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP5P82980 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP5P82980 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP5P82980 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP5P82980 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP5P82980 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP5P82980 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP5P82980 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP5P82980 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP5P82980 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBP5P82980 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms