Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP46P62068 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP46P62068 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP46P62068 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP46P62068 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP46P62068 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
USP46P62068 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP46P62068 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP46P62068 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP46P62068 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP46P62068 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP46P62068 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP46P62068 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP46P62068 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP46P62068 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP46P62068 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP46P62068 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP46P62068 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP46P62068 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP46P62068 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP46P62068 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
USP46P62068 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP46P62068 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP46P62068 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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USP46P62068 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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USP46P62068 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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USP46P62068 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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USP46P62068 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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USP46P62068 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP46P62068 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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