Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms