Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms