Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms