Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms