Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms