Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms