Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUD6

RNF135, E3 ubiquitin-protein ligase RNF135, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF135Q8IUD6 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RNF135Q8IUD6 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RNF135Q8IUD6 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RNF135Q8IUD6 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RNF135Q8IUD6 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RNF135Q8IUD6 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RNF135Q8IUD6 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RNF135Q8IUD6 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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RNF135Q8IUD6 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF135Q8IUD6 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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