Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms