Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms