Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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