Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms