Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RPA4Q13156 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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RPA4Q13156 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RPA4Q13156 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RPA4Q13156 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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