Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPAP53621 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms