Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBRP36941 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBRP36941 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBRP36941 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBRP36941 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBRP36941 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBRP36941 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBRP36941 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBRP36941 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBRP36941 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBRP36941 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBRP36941 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBRP36941 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBRP36941 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBRP36941 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBRP36941 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBRP36941 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBRP36941 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBRP36941 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBRP36941 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBRP36941 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBRP36941 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBRP36941 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBRP36941 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBRP36941 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBRP36941 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms