Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms